Rumeli Beylerbeyliği ile Anadolu Beylerbeyliği arasında, protokol açısından bir hiyerarşi farkı vardı. Rumeli Beylerbeyliği genelde Anadolu Beylerbeyliği'nin bir adım önünde kabul edilirdi. Bunun temel nedenlerinden biri, Rumeli topraklarının Osmanlı Devleti'nin genişleme politikalarındaki merkezi rolüydü.
Osmanlı Devleti’nin başkenti olan İstanbul, Rumeli topraklarında yer aldığı için, Rumeli Beylerbeyliği stratejik olarak daha önemli bir konuma sahipti. Ayrıca, batıya doğru fetihlerin ağırlık kazandığı bir dönemde, bu bölge daha öncelikli hale gelmişti. Rumeli Beylerbeyi, bu sebeplerle Anadolu Beylerbeyi'ne kıyasla daha etkin ve kritik bir pozisyona sahip olurdu.
Ama unutmamak lazım ki her iki beylerbeyi de padişaha bağlıydı ve devlet yönetiminde büyük yetkilere sahipti. Protokoldeki bu fark, yalnızca idari ve stratejik önceliklerin bir yansımasıydı.
